——新技术可以改变科学家观察和解读显微图像的方式
《科学进展》(Science Advances)九月刊的封面展示了通过激光扫描共聚焦显微镜(LSCM)获得的肾脏切片三维图像。三种颜色分别对应三种荧光染色剂:DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚,4',6-diamidino-2-phenylindole,紫色)、鬼笔环肽(Phalloidin,蓝色)和小麦胚芽凝集素(wheat germ agglutinin,黄色)。激光显微镜是生物学研究的重要工具,但所获取图像的内容和质量限制了对生物现象的观察。Shu Jia实验室的新研究提高了图像质量,可能会改变科学家观察和解释显微图像的方式。
佐治亚理工学院和埃默里大学(Georgia Tech and Emory)的研究团队提出了一种革命性的系统,用于提高荧光显微镜图像的清晰度和质量。他们的创新成果——“通过最佳解析表示进行多尺度图像复原(MIRO)”,可以改变科学家观察和解释显微图像的方式。
佐治亚理工学院和埃默里大学华莱士·H·库尔特生物医学工程系教授Shu Jia说:“这有可能拓展生物知识的视野。”他们的突破性研究成果作为封面故事发表在九月的《科学进展》杂志上。
荧光显微镜是生物学研究中无与伦比的工具,它能揭示细胞结构的深度和功能。但Shu Jia强调,需要提高图像的清晰度。
他说:“当前成像探测器的固有局限性带来了重大挑战,各种噪声源使成像结果变得模糊不清。”
这种噪音会妨碍荧光信号的精确观测,从而限制荧光显微镜的全部潜力。
该研究的第一作者Biagio Mandracchia曾是Shu Jia实验室的博士后,目前是西班牙巴利亚多利德大学(University de Valladolid)的独立研究员,他说:“这导致生成的图像被噪声破坏,使研究人员无法获得最佳视觉数据进行分析。”
Jia说:“MIRO提供了一种全面的算法,可以克服与显微镜有关的所有噪声源。”Jia的合作者包括库尔特系教授Shuichi Takayama、佐治亚理工学院生物科学院的Shuyi Nie和埃默里医学院儿科教授Chunhui Xu。
“与仅针对特定显微镜或相机类型的现有方法不同,MIRO是一种自适应、可通用的解决方案。”Jia补充道:“这种稳健的方法包含一个理论模型,能够识别所有常见的噪声类型,同时从周围的噪声中提取生物特征。”
实际上,MIRO的能力通过应用于各种荧光显微镜技术得到了验证。结果显示出无比清晰的图像,增强了对标本的观察和下游分析。
研究团队还将MIRO与深度神经网络相结合,这是确定性知识与机器智能的结合,为快速、高质量的图像去噪铺平了道路。
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来源:佐治亚理工学院和埃默里大学华莱士·H·库尔特生物医学工程系官网
标题:Designing the Future of Image Restoration in Fluorescence Microscopy